硅藻不含纤维素等成分，作为天然饵料能很好地被水产动物摄食并消化，营养丰富。本身及其代谢产物无毒, 不影响幼体、苗种的正常生长，同时硅藻还可以净化水质、维持水体的生态平衡，属于常见的有益藻，在淡水养殖中，以硅藻为优势种群的水体多呈茶色或茶褐色，一直被公认为是水产养殖的最佳水质之一。

硅藻一般适合低温使用，小球藻适合温度较高使用，另外针对不同的养殖对象选择的相同温度下选择的种类也不同，比如养虾时高温选择小球藻，低温选择硅藻；河蟹整个养殖中都是以硅藻为主的；海参养殖中也是以硅藻为主，但高温休眠时可以适当补充小球藻；鱼类低温选择硅藻，高温选择小球藻。养殖户们不仅要根据温度还要根据养殖对象的种类进行藻种的选择。