硅藻门，植物体单细胞，或由细胞彼此连成链状、带状、丛状、放射状的群体，浮游或着生，着生种类常具胶质柄或包被在胶质团或胶质管中。细胞壁除含果胶质外，含有大量的复杂硅质结构，形成坚硬的壳体。壳体由上壳和下壳组成，上下两壳都各由盖板和缘板两部分组成，以壳环套合形成 1 个硅藻细胞，垂直面为壳面观，水平面为带面观；上下壳的壳环带互相套合部分为“接合带”，接合带两侧鳞片状、带状或领状结构为“间生带”，间生带向细胞内部延伸呈舌状“隔片”，壳面生出的突起为“小棘”。

细胞带面多为长方形，有的呈鼓形、圆柱形；壳面呈圆形、三角形、多角形、椭圆形、卵形、线形、披针形、菱形、舟形、新月形、弓形、“S”形、棒形、提琴形等，辐射对称或两侧对称；壳面常见由细胞壁上的许多小孔紧密或较稀疏排列而成的线纹，壳面壁两侧有狭长横列的小室，形成“U”形的粗花纹，称“肋纹”，在壳的边缘有纵走的凸起，称“龙骨”。

壳面中部或偏于一侧具 1 条纵向的无纹平滑区，称“中轴区”；中轴区中部，横线纹较短，形成面积较大的“中央区”；中央区中部，壳内壁增厚形成“中央节”；中央节两侧，沿中轴区中部有 1 条纵向的裂缝，称“壳缝”；壳缝两端的壳内壁各有 1 个增厚部分，称“极节”；有的种类无壳缝，仅有较狭窄的中轴区，称“假壳缝”；有的种类的壳缝是 1 条纵走的或围绕壳缘的管沟，以极狭的裂缝与外界相通，管沟的内壁数量不等的小孔与细胞内部相连，称“管壳缝”；壳缝与运动有关。

硅藻细胞色素体为小圆盘状、片状、星状，1 个、2 个或多个，色素体中主要含有叶绿素 a 和叶绿素 c、β- 胡萝卜素以及 α- 胡萝卜素、墨角藻黄素、硅甲黄素和硅藻黄素，呈黄绿色或黄褐色，有些种类具无淀粉鞘的裸露的蛋白核，光合作用产物主要是金藻昆布糖和脂肪。

硅藻类不但种类繁多，而且分布极广，生长在淡水、半咸水、海水中，或在潮湿的土壤、岩石、树皮的表面，或高等水生植物丛中及苔藓中，一年四季都能生长繁殖。在夏季、秋季等高温季节，有的硅藻在湖泊、海洋中大量繁殖，形成水华和赤潮。

常见硅藻门种类 2 纲 8 目 14 科 44 属。

小环藻属

沟链藻属

直链藻属

冠盘藻属

圆筛藻属

海链藻属

中肋骨条藻（S. costatum）

近盐骨条藻（S. subsalsum）

环冠藻属

碟星藻属

诺氏辐环藻（A. normanii）

四棘藻属

脆杆藻属

肘形藻属