水产养殖肥水的目的是为了培养出有益的菌和藻，并且能够平衡有益菌和有益藻的生长和繁殖。水中基本的营养物质是由碳、氮、磷、钾等及其微量元素和大量的有机质组成；而水中有益菌类和有益藻类所需要的营养物质各不相同，养殖池塘中所含有的营养物质决定了藻类的生长趋向和菌类的生长趋向。而水产养殖中水的营养比有两个很重要：碳氮比、氮磷比。

水体中有益菌的生长繁殖所需要的碳氮比为20~30：1，也就是说有益菌想要分解1份的氮就需要20~30份的碳。一般情况下水体中是不缺乏氮源的，残饵、未消化的粪便，死亡的藻类和虫子都含有大量的氮源，而这些氮源又是有益菌类和有益藻类所必需的营养，如果这些氮源含量过多，有益藻类和有益菌类利用不完时就会有所剩余，在溶氧不足的情况下形成氨态氮和硝态氮最终成为有毒有害氨氮和亚盐。有益藻类的生长和繁殖，同样需要碳源的参与，而最理想的碳氮比为6:1。为了达到有益菌类和有益藻类的平衡，建议水体中的碳氮比维持在15:1。

所以当水中氨氮和亚盐超标时，在增加水体溶氧的同时，补充有益菌类，如：芽孢菌、EM菌、光合菌、乳酸菌等，补充一定量红糖、糖蜜等有机碳源，就增加了有益菌类和有益藻类分解氮源的能力，从而降解水中的氨氮和亚盐。同样在肥水时，为了促进有益藻类和有益菌类的生长繁殖，每亩使用5~7斤的红糖补充有机碳源，配合补充有益藻类，增加肥水成功的几率。

有益藻类的生长和繁殖与水中的氮磷含量有直接关系，当水中总氮与总磷的浓度比值在12：1~13：1 时，平均值为12：1，有利藻类生长，但铜绿微囊藻在中氮磷比(N/P=4.5)下生长最好,颤藻在低氮磷比(N/P=0.45)下生长最好，所以从数值可发现，在高氮、高磷的环境下，氮磷比偏低，磷含量过高时，蓝藻容易爆发。

从上面的数据分析得知水体中如果缺乏磷元素时，藻类也不易培养；当肥水效果不理想藻类难以培养时，要考虑是否是磷含量不足，适当的补充磷含量，可以提高肥水效果从而更好的培养有益藻类。