养殖水体是人为制造的生态环境，是一个综合的水体，是各种生物繁荣共生的关系。藻类的种类很多，随着季节，温度，光照，以及菌相和池水有机质含量的高低而变化，这也是自然界的规律，而我们要保证藻相一直是有益于养殖对象的藻相，其实这是一个违反自然规律的行为。
藻类的形成和组合与所处环境，温度以及养殖模式有很大的关系。

在自然环境下，受季节和温度变化的影响，这些藻类会交替出现，各占优势一段时间，但是其他藻类也会同时存在，只是数量较少。

就温度而言，水温25度以下是硅藻的旺季，30度是绿藻的旺季，35度蓝藻的旺季，裸藻隐藻适应温度广，它们的盛衰决定于水体的有机质和富营养。

在春季水温在25度左右（含25度以下）浮动时，这时是以硅藻和绿藻门中的小型单细胞藻类为主体。

以后随着温度的升高，和硅肥的缺乏，硅藻会逐渐减少成弱势。这时以稍大型的绿藻加上蓝藻形成优势群体，以后随着温度的升高和有机质的快速增加，水体得富营养化，绿藻会减少成弱势。这时蓝藻裸藻会形成优势，以后随着温度的下降，隐藻和硅藻会形成优势，等到了冬季又恢复到硅藻和小型绿藻。
蓝藻甲藻的形成有两种原因。

一是随着季节变化温度升高，光照增强，而池塘内又没有形成有绝对优势的藻类群体，水体中藻类的数量较少。

二是水体中以藻类为食的，虫类的选择性食藻，而造成了蓝藻甲藻的无节制泛滥。
温度的升高，水体有机质增加，水体富营养，个体稍大些的藻类就会率先得到发展壮大的机会，而具体何种藻类会成为主体，则取决于藻源的多少和适宜的环境。如水清瘦会起微囊藻，水富营养会起裸藻……
任何一种藻类的繁盛和壮大都离不开适宜的环境和充足的肥料，这是前提条件。

任何物种的种群之间都存在生物的竞争，为了自己种群的生存和发展，各种生物之间都有各自的独到之处。

一方面为了自己的发展铺平道路，另一方面限制其它种群的发展，排除异己。藻类也不例外。正因为如此，我们可以利用藻类的这一特征来制造我们想要的藻像。
有害藻类之所以被称为有害藻类，就是因为它在自身壮大的同时向水中释放的藻毒素对于养殖对象有毒，会毒害养殖对象。但是，有害藻类所排出的毒素，必须要达到一定的浓度才能对养殖对象构成危害；而有益藻类所释放的藻毒素对于养殖对象无害。