池塘底部的组成包括原始底部，一般称为土壤，以及土壤之上的，在养殖过程中由养殖动物粪便、残饵、各种死亡水生生物的尸体以及有机碎屑等构成的沉淀物。由于在池塘生物以及人工池塘操作的搅动下，原始土壤与沉淀物会有一定程度的混合，成为淤泥。对于地膜池和水泥池而言，底部只是沉淀物。

原始底部

土塘原始底部一般称为土壤，按土壤分类系统可分为壤土、沙土、粘土、粉土等。主要由矿物组成，有机物质含量一般在1～5%左右。不同土壤具有不同的物理和生物化学特性。两种对池塘养殖影响比较大的极端土壤为硫含量大于0.75%的酸性硫酸盐土壤和盐含量在0.1%～0.2%以上，或者土壤胶体吸附一定数量的交换性钠，碱化度在15%～20%以上的盐碱土壤。遇到这样的养殖环境除了进行必要的改造之外，养殖生产过程的定向改良最为关键。

沉淀物

沉淀物是在养殖期间形成的，其中的矿物主要来自堤岸的侵蚀，除了黄河水外，水源带进来的可沉降矿物很少，而饲料中带进来的矿物也微乎其微。沉淀物中的有机物质主要来自粪便、残饵、死亡的生物和微生物絮团。沉淀物本质上是一种“碳汇”或“氧债”。